Per 1 mei 2011 is dr. Martin den Heijer benoemd tot hoogleraar interne geneeskunde, in het bijzonder de endocrinologie, aan het VU Medisch Centrum Amsterdam. In verband hiermee zal hij binnenkort het UMC St Radboud verlaten.
Martin den Heijer is vanaf 1997 aan het UMC St Radboud verbonden geweest. Vanaf 2001 is hij staflid van de afdeling Endocriene Ziekten, naast zijn aanstelling bij de afdeling Epidemiologie, Biostatistiek en HTA. In 2006 werd hij benoemd tot Universitair Hoofddocent “endocriene en metabole determinanten van hart- en vaatziekten”.
Behalve op endocrinologie heeft hij zich in Nijmegen toegelegd op erfelijke metabole ziekten. Daarnaast heeft hij zich, als coördinator van de zeer succesvolle Nijmeegse Biomedische Studie, geprofileerd op het gebied van epidemiologie. Veel Nijmeegse onderzoekers hebben geprofiteerd van zijn grote methodologische kennis.