Het Onderwijsbureau van het IWOO verzorgt de mede ontwikkeling, coördinatie, ondersteuning en evaluatie van het academisch onderwijs en is hiervoor onderverdeeld in vijf teams: 2 ten behoeve van de (logistieke) ondersteuning van zowel de initiële opleidingen als de post-initiële opleidingen, waarbij centraal staat het optimaal laten verlopen van het onderwijs en 3 die discipline overstijgend actief zijn, te weten:
- het EKO-team (Evaluatie, Kwaliteit en Ontwikkeling), waarin expertise is samengebracht over ontwikkeling en onderzoek van het onderwijs; essentieel om de toppositie van de opleidingen te behouden;
- het ICTO-team (ICT in het Onderwijs), waarin de expertise is samengebracht die nodig is voor de verdere ontwikkeling van ICT als geïntegreerd onderdeel van het onderwijsproces;
- het O&A team (Ondersteuning en Assistentie), waarin alle expertise is samengebracht op het gebied van de amanuensisdienst, simulatiepatiënten en docenten gynaecologisch onderzoek.